Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01662 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01662 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01662 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms