Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01661 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01661 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01661 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01661 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01661 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01661 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms