Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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