Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms