Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms