Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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