Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timm44O35857 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timm44O35857 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms