Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc1a6O35544 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc1a6O35544 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc1a6O35544 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc1a6O35544 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc1a6O35544 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc1a6O35544 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc1a6O35544 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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