Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Clk2O35491 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Clk2O35491 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Clk2O35491 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Clk2O35491 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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