Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms