Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms