Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Slc25a13-201ENSMUST00000015256 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Zfp94-202ENSMUST00000108436 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PrkcshO08795 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PrkcshO08795 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PrkcshO08795 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 A3galt2-201ENSMUST00000030585 3390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Prpf6-201ENSMUST00000002529 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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