Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sema3aO08665 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms