Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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