Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm20939L7N243 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm20939L7N243 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm20939L7N243 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm20939L7N243 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm20939L7N243 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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