Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3415J3QMS8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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