Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Farp1F8VPU2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Farp1F8VPU2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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