Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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