Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm28048F7BCN0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm28048F7BCN0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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