Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21876F6XK35 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms