Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17555F6U8B9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms