Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms