Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kif28pD3YXS5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kif28pD3YXS5 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms