Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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