Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zbed5B2RPU8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms