Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms