Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Brpf3B2KF05 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Brpf3B2KF05 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Brpf3B2KF05 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Brpf3B2KF05 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms