Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn7aB1AYL1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn7aB1AYL1 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn7aB1AYL1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms