Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms