Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ttll11A4Q9F4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms