Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms