Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms