Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms