Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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