Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Upk1bQ9Z2C6 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk1bQ9Z2C6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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