Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme3Q9WV85 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms