Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms