Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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