Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ripk3Q9QZL0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ripk3Q9QZL0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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