Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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