Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms