Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms