Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DysfQ9ESD7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DysfQ9ESD7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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