Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms