Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms