Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Clstn1Q9EPL2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms