Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms