Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arpc5lQ9D898 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Arpc5lQ9D898 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Arpc5lQ9D898 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Gm28775-201ENSMUST00000186918 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Arpc5lQ9D898 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Arpc5lQ9D898 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Arpc5lQ9D898 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms