Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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