Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdr42e1Q9D665 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms